Dee nasceu em 13 de julho de 1527 às 16h02, perto de Londres. Ele não deixou nenhum registro de interpretação de seu próprio mapa, mas sabemos que ele conseguiu traçar as posições em poucos minutos, sem dúvida usando uma das quinze efemérides que ele tinha em sua posse.

Dee era um verdadeiro homem da Renascença. Era imerso no aprendizado de assuntos como astronomia, matemática, geografia, história e ciência. Foi um brilhante palestrante e demonstrador, sondando os segredos de sua vasta leitura, associações estrangeiras e sua biblioteca única lhe deram uma consciência que talvez fosse mais profunda do que outras de sua época. Seu interesse por tais assuntos era lendário e suas contribuições para a Inglaterra nessas áreas eram extensas. Seus escritos incluíam assuntos como navegação, história, geometria, astrologia e muitos outros. Seu trabalho na navegação foi de considerável vantagem para os esforços da Inglaterra para forjar novas áreas de domínio no mundo. Mas, o mais importante para Dee, ele era um cabalista cristão, que estava bem ciente do mundo supercelestial dos anjos e poderes divinos. Frances Yates comentou que, para realmente entender John Dee, devemos enfrentar o fato de que ele era um seguidor de Cornelius Agrippa e tentou aplicar a filosofia “oculta” durante toda a sua vida e trabalhá-la em tudo o que fez.

Durante o tempo do reinado de Maria, Dee iniciou uma obra própria, Propaedeumata Aphoristica (Preliminary Aphoristic Teachings), uma série de máximas explicando os poderes astrológicos por processos racionais. Ele queria entender como os eventos celestes influenciavam os sublunares. Dee acreditava que quando Deus criou o universo, ele soltou uma força divina, que fez os planetas girarem, o Sol se levantar e a Lua aumentar e diminuir. Magia é a habilidade humana de explorar essa força. Quanto melhor a nossa compreensão do modo como conduz o universo, mais poderosa é a magia. Dee teorizou que cada entidade no universo emanava “raios” ou uma força que influencia outros objetos atingidos. Ele tomou como exemplo as forças de atração e repulsão produzidas pelo minério de ferro “magnetita” – magnetizado. Isso demonstrou em miniatura o que estava acontecendo em todo o universo. A característica importante dos “raios” para Dee era que eles poderiam ser estudados cientificamente. Ele pediu por estudos astronômicos mais detalhados, para que os verdadeiros tamanhos e distâncias e, portanto, influências dos corpos celestes pudessem ser estabelecidos. Isso se tornou a base da filosofia natural de Dee e, de várias maneiras, antecipa Principia Mathematica, de Isaac Newton. Como Newton, Dee acreditava que o universo funcionava de acordo com as leis matemáticas. Dee planejara que o Propaedeumata fosse seu “magnum opus”. No entanto, duas epidemias devastadoras de gripe em 1557/58 deram a Dee razões para acreditar que seus dias estavam contados. Ele se apressou em terminá-lo e conseguiu que um rascunho fosse publicado no caso de sua morte. No entanto, a crença em sua morte iminente foi um tanto prematura e ele passou a viver outros cinquenta anos muito frutíferos.